სამინისტროს საქმიანობის საქართველოს კანონმდებლობასთან შესაბამისობის მონიტორინგი;
სამინისტროს საქმიანობის ეკონომიურობის, ეფექტურობის და ეფექტიანობის გაზრდის და გაუმჯობესების მიზნით რეკომენდაციების შემუშავება;
ხელმძღვანელობის მიერ რისკის იდენტიფიკაციისა და რისკის მართვის პროცესის შეფასება;
სამინისტროს აქტივების, სხვა რესურსებისა და ინფორმაციის დაცვის ადეკვატურობის შეფასება;
სხვა საქმიანობა, რომელიც არ ეწინააღმდეგება საქართველოს კანონმდებლობას და შიდა აუდიტორების დამოუკიდებლობის პრინციპებს;
სამინისტროს თანამშრომელთა მიერ კანონმდებლობის მოთხოვნათა დარღვევის ფაქტების შემოწმება და/ან დისციპლინარული დევნის განხორციელება;
სახელმწიფო სექტორში შიდა კონტროლთან დაკავშირებული საკითხების კოორდინირება და ჰარმონიზაცია.
შიდა აუდიტის დეპარტამენტი
- მონიტორინგის და შიდა კონტროლის სამმართველო
- ინსპექტირების სამმართველო
- შიდა აუდიტის ჰარმონიზაციის სამმართველო